决策树实战

一、CART算法

1、基于iris数据集,构造CART分类树

# encoding=utf-8
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.metrics import accuracy_score
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.datasets import load_iris
# 准备数据集
iris=load_iris()
# 获取特征集和分类标识
features = iris.data
labels = iris.target
# 随机抽取33%的数据作为测试集,其余为训练集
train_features, test_features, train_labels, test_labels = train_test_split(features, labels, test_size=0.33, random_state=0)
# 创建CART分类树
clf = DecisionTreeClassifier(criterion='gini')
# 拟合构造CART分类树
clf = clf.fit(train_features, train_labels)
# 用CART分类树做预测
test_predict = clf.predict(test_features)
# 预测结果与测试集结果作比对
score = accuracy_score(test_labels, test_predict)
print("CART分类树准确率 %.4lf" % score)
CART分类树准确率 0.9600

2、基于波士顿房价数据集,构造CART回归树

# encoding=utf-8
from sklearn.metrics import mean_squared_error
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.datasets import load_boston
from sklearn.metrics import r2_score,mean_absolute_error,mean_squared_error
from sklearn.tree import DecisionTreeRegressor
# 准备数据集
boston=load_boston()
# 探索数据
print(boston.feature_names)
['CRIM' 'ZN' 'INDUS' 'CHAS' 'NOX' 'RM' 'AGE' 'DIS' 'RAD' 'TAX' 'PTRATIO'
 'B' 'LSTAT']
# 获取特征集和房价
features = boston.data
prices = boston.target
# 随机抽取33%的数据作为测试集,其余为训练集
train_features, test_features, train_price, test_price = train_test_split(features, prices, test_size=0.33)
# 创建CART回归树
dtr=DecisionTreeRegressor()
# 拟合构造CART回归树
dtr.fit(train_features, train_price)
DecisionTreeRegressor(ccp_alpha=0.0, criterion='mse', max_depth=None,
                      max_features=None, max_leaf_nodes=None,
                      min_impurity_decrease=0.0, min_impurity_split=None,
                      min_samples_leaf=1, min_samples_split=2,
                      min_weight_fraction_leaf=0.0, presort='deprecated',
                      random_state=None, splitter='best')
# 预测测试集中的房价
predict_price = dtr.predict(test_features)
# 测试集的结果评价
print('回归树二乘偏差均值:', mean_squared_error(test_price, predict_price))
print('回归树绝对值偏差均值:', mean_absolute_error(test_price, predict_price))
回归树二乘偏差均值: 16.846706586826347
回归树绝对值偏差均值: 2.683832335329341

二、Sklearn 决策树实战

到目前为止,sklearn 中只实现了 ID3 与 CART 决策树,所以我们暂时只能使用这两种决策树,在构造 DecisionTreeClassifier 类时,其中有一个参数是 criterion,意为标准。它决定了构造的分类树是采用 ID3 分类树,还是 CART 分类树,对应的取值分别是 entropy 或者 gini。

泰坦尼克数据

import pandas as pd
# 数据加载
train_data = pd.read_csv('/Users/liming/Downloads/Titanic_Data-master/train.csv')
test_data = pd.read_csv('/Users/liming/Downloads/Titanic_Data-master/test.csv')

模块一:数据探索

# 数据探索
print(train_data.info())
print('-'*70)
print(train_data.describe())
print('-'*70)
print(train_data.describe(include=['O']))
print('-'*90)
print(train_data.head())
print('-'*90)
print(train_data.tail())
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 891 entries, 0 to 890
Data columns (total 12 columns):
 #   Column       Non-Null Count  Dtype  
---  ------       --------------  -----  
 0   PassengerId  891 non-null    int64  
 1   Survived     891 non-null    int64  
 2   Pclass       891 non-null    int64  
 3   Name         891 non-null    object 
 4   Sex          891 non-null    object 
 5   Age          714 non-null    float64
 6   SibSp        891 non-null    int64  
 7   Parch        891 non-null    int64  
 8   Ticket       891 non-null    object 
 9   Fare         891 non-null    float64
 10  Cabin        204 non-null    object 
 11  Embarked     889 non-null    object 
dtypes: float64(2), int64(5), object(5)
memory usage: 83.7+ KB
None
----------------------------------------------------------------------
       PassengerId    Survived      Pclass         Age       SibSp  \
count   891.000000  891.000000  891.000000  714.000000  891.000000   
mean    446.000000    0.383838    2.308642   29.699118    0.523008   
std     257.353842    0.486592    0.836071   14.526497    1.102743   
min       1.000000    0.000000    1.000000    0.420000    0.000000   
25%     223.500000    0.000000    2.000000   20.125000    0.000000   
50%     446.000000    0.000000    3.000000   28.000000    0.000000   
75%     668.500000    1.000000    3.000000   38.000000    1.000000   
max     891.000000    1.000000    3.000000   80.000000    8.000000   

            Parch        Fare  
count  891.000000  891.000000  
mean     0.381594   32.204208  
std      0.806057   49.693429  
min      0.000000    0.000000  
25%      0.000000    7.910400  
50%      0.000000   14.454200  
75%      0.000000   31.000000  
max      6.000000  512.329200  
----------------------------------------------------------------------
                     Name   Sex    Ticket Cabin Embarked
count                 891   891       891   204      889
unique                891     2       681   147        3
top     Balkic, Mr. Cerin  male  CA. 2343    G6        S
freq                    1   577         7     4      644
------------------------------------------------------------------------------------------
   PassengerId  Survived  Pclass  \
0            1         0       3   
1            2         1       1   
2            3         1       3   
3            4         1       1   
4            5         0       3   

                                                Name     Sex   Age  SibSp  \
0                            Braund, Mr. Owen Harris    male  22.0      1   
1  Cumings, Mrs. John Bradley (Florence Briggs Th...  female  38.0      1   
2                             Heikkinen, Miss. Laina  female  26.0      0   
3       Futrelle, Mrs. Jacques Heath (Lily May Peel)  female  35.0      1   
4                           Allen, Mr. William Henry    male  35.0      0   

   Parch            Ticket     Fare Cabin Embarked  
0      0         A/5 21171   7.2500   NaN        S  
1      0          PC 17599  71.2833   C85        C  
2      0  STON/O2. 3101282   7.9250   NaN        S  
3      0            113803  53.1000  C123        S  
4      0            373450   8.0500   NaN        S  
------------------------------------------------------------------------------------------
     PassengerId  Survived  Pclass                                      Name  \
886          887         0       2                     Montvila, Rev. Juozas   
887          888         1       1              Graham, Miss. Margaret Edith   
888          889         0       3  Johnston, Miss. Catherine Helen "Carrie"   
889          890         1       1                     Behr, Mr. Karl Howell   
890          891         0       3                       Dooley, Mr. Patrick   

        Sex   Age  SibSp  Parch      Ticket   Fare Cabin Embarked  
886    male  27.0      0      0      211536  13.00   NaN        S  
887  female  19.0      0      0      112053  30.00   B42        S  
888  female   NaN      1      2  W./C. 6607  23.45   NaN        S  
889    male  26.0      0      0      111369  30.00  C148        C  
890    male  32.0      0      0      370376   7.75   NaN        Q  

模块二:数据清洗

通过数据探索,我们发现 Age、Cabin 和 Embarked 这三个字段的数据有所缺失。其中 Age 为年龄字段,是数值型,我们可以通过平均值进行补齐。

# 使用平均年龄来填充年龄中的nan值
train_data['Age'].fillna(train_data['Age'].mean(), inplace=True)
test_data['Age'].fillna(test_data['Age'].mean(),inplace=True)
# 使用票价的均值填充票价中的nan值
train_data['Fare'].fillna(train_data['Fare'].mean(), inplace=True)
test_data['Fare'].fillna(test_data['Fare'].mean(),inplace=True)

Cabin 为船舱,有大量的缺失值。在训练集和测试集中的缺失率分别为 77% 和 78%,无法补齐;Embarked 为登陆港口,有少量的缺失值,我们可以把缺失值补齐。

首先观察下 Embarked 字段的取值,方法如下:

print(train_data['Embarked'].value_counts())
S    646
C    168
Q     77
Name: Embarked, dtype: int64

我们发现一共就 3 个登陆港口,其中 S 港口人数最多,占到了 72%,因此我们将其余缺失的 Embarked 数值均设置为 S:

# 使用登录最多的港口来填充登录港口的nan值
train_data['Embarked'].fillna('S', inplace=True)
test_data['Embarked'].fillna('S',inplace=True)

模块三:特征选择

特征选择是分类器的关键。特征选择不同,得到的分类器也不同。那么我们该选择哪些特征做生存的预测呢?

通过数据探索我们发现,PassengerId 为乘客编号,对分类没有作用,可以放弃;Name 为乘客姓名,对分类没有作用,可以放弃;Cabin 字段缺失值太多,可以放弃;Ticket 字段为船票号码,杂乱无章且无规律,可以放弃。其余的字段包括:Pclass、Sex、Age、SibSp、Parch 和 Fare,这些属性分别表示了乘客的船票等级、性别、年龄、亲戚数量以及船票价格,可能会和乘客的生存预测分类有关系。具体是什么关系,我们可以交给分类器来处理。

因此我们先将 Pclass、Sex、Age 等这些其余的字段作特征,放到特征向量 features 里。

# 特征选择
features = ['Pclass', 'Sex', 'Age', 'SibSp', 'Parch', 'Fare', 'Embarked']
train_features = train_data[features]
train_labels = train_data['Survived']
test_features = test_data[features]

特征值里有一些是字符串,这样不方便后续的运算,需要转成数值类型,比如 Sex 字段,有 male 和 female 两种取值。我们可以把它变成 Sex=male 和 Sex=female 两个字段,数值用 0 或 1 来表示。

同理 Embarked 有 S、C、Q 三种可能,我们也可以改成 Embarked=S、Embarked=C 和 Embarked=Q 三个字段,数值用 0 或 1 来表示。

那该如何操作呢,我们可以使用 sklearn 特征选择中的 DictVectorizer 类,用它将可以处理符号化的对象,将符号转成数字 0/1 进行表示。具体方法如下:

from sklearn.feature_extraction import DictVectorizer
dvec = DictVectorizer(sparse=False)
train_features = dvec.fit_transform(train_features.to_dict(orient='record'))

你会看到代码中使用了 fit_transform 这个函数,它可以将特征向量转化为特征值矩阵。然后我们看下 dvec 在转化后的特征属性是怎样的,即查看 dvec 的 feature_names_ 属性值,方法如下:

print(dvec.feature_names_)
['Age', 'Embarked=C', 'Embarked=Q', 'Embarked=S', 'Fare', 'Parch', 'Pclass', 'Sex=female', 'Sex=male', 'SibSp']

你可以看到原本是一列的 Embarked,变成了“Embarked=C”“Embarked=Q”“Embarked=S”三列。Sex 列变成了“Sex=female”“Sex=male”两列。这样 train_features 特征矩阵就包括 10 个特征值(列),以及 891 个样本(行),即 891 行,10 列的特征矩阵。

模块四:决策树模型

刚才我们已经讲了如何使用 sklearn 中的决策树模型。现在我们使用 ID3 算法,即在创建 DecisionTreeClassifier 时,设置 criterion=‘entropy’,然后使用 fit 进行训练,将特征值矩阵和分类标识结果作为参数传入,得到决策树分类器。

from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
# 构造ID3决策树
clf = DecisionTreeClassifier(criterion='entropy')
# 决策树训练
clf.fit(train_features, train_labels)
DecisionTreeClassifier(ccp_alpha=0.0, class_weight=None, criterion='entropy',
                       max_depth=None, max_features=None, max_leaf_nodes=None,
                       min_impurity_decrease=0.0, min_impurity_split=None,
                       min_samples_leaf=1, min_samples_split=2,
                       min_weight_fraction_leaf=0.0, presort='deprecated',
                       random_state=None, splitter='best')

模块五:模型预测和评估

在预测中,我们首先需要得到测试集的特征值矩阵,然后使用训练好的决策树 clf 进行预测,得到预测结果 pred_labels:

test_features=dvec.transform(test_features.to_dict(orient='record'))
# 决策树预测
pred_labels = clf.predict(test_features)

在模型评估中,决策树提供了 score 函数可以直接得到准确率,但是我们并不知道真实的预测结果,所以无法用预测值和真实的预测结果做比较。我们只能使用训练集中的数据进行模型评估,可以使用决策树自带的 score 函数计算下得到的结果:

# 得到决策树准确率
acc_decision_tree = round(clf.score(train_features, train_labels), 6)
print(u'score准确率为 %.4lf' % acc_decision_tree)
score准确率为 0.9820

你会发现你刚用训练集做训练,再用训练集自身做准确率评估自然会很高。但这样得出的准确率并不能代表决策树分类器的准确率。

这是为什么呢?

因为我们没有测试集的实际结果,因此无法用测试集的预测结果与实际结果做对比。如果我们使用 score 函数对训练集的准确率进行统计,正确率会接近于 100%(如上结果为98.2%),无法对分类器的在实际环境下做准确率的评估。

那么有什么办法,来统计决策树分类器的准确率呢?

这里可以使用 K 折交叉验证的方式,交叉验证是一种常用的验证分类准确率的方法,原理是拿出大部分样本进行训练,少量的用于分类器的验证。K 折交叉验证,就是做 K 次交叉验证,每次选取 K 分之一的数据作为验证,其余作为训练。轮流 K 次,取平均值。

K 折交叉验证的原理是这样的:

  • 将数据集平均分割成 K 个等份;
  • 使用 1 份数据作为测试数据,其余作为训练数据;
  • 计算测试准确率;
  • 使用不同的测试集,重复 2、3 步骤。

在 sklearn 的 model_selection 模型选择中提供了 cross_val_score 函数。cross_val_score 函数中的参数 cv 代表对原始数据划分成多少份,也就是我们的 K 值,一般建议 K 值取 10,因此我们可以设置 CV=10,我们可以对比下 score 和 cross_val_score 两种函数的正确率的评估结果:

import numpy as np
from sklearn.model_selection import cross_val_score
# 使用K折交叉验证 统计决策树准确率
print(u'cross_val_score准确率为 %.4lf' % np.mean(cross_val_score(clf, train_features, train_labels, cv=10)))
cross_val_score准确率为 0.7768

你可以看到,score 函数的准确率为 0.9820,cross_val_score 准确率为 0.7835。这里很明显,对于不知道测试集实际结果的,要使用 K 折交叉验证才能知道模型的准确率。

模块六:决策树可视化

sklearn 的决策树模型对我们来说,还是比较抽象的。我们可以使用 Graphviz 可视化工具帮我们把决策树呈现出来。